مسیحی شدن Yaquis همان چیزی بود که به مذهبی ها اجازه می داد در سال 1609 به خاک سونورا نفوذ کنند.
در طول مستعمره ، Sonora فقط با دامنه های Sierra Madre Occidental که در محدوده آن موجودیت بود ، مطابقت داشت. منطقه ای که از رودخانه Yaqui به شمال کشیده می شد ، از جمله Real de la Cieneguilla ، Pimería Baja و شمالی ترین منطقه از آن رئال تا رود کلرادو - از قبل در ایالت آریزونا فعلی آمریکای شمالی - نامیده می شد Pimería Alta.
قلمرو کنونی سونوران همچنین شامل یک منطقه کوچک در جنوب غربی منطقه ای است که در آن زمان به نام پیمریا معروف بود ، واقع در ایالت چیهواوا و اوستیموری ، مکانی واقع در سواحل خلیج کالیفرنیا ، بین رودخانه های مایو و یاکی.
در سال 1614 مبلغین پرز دو ریواس و پدرو مندز مایاهای منطقه اوستیموری را مسیحی کردند و این مأموریت را به سه منطقه سانتاکروز (در دهانه مایو) ، ناوووجا و تسیا تقسیم کردند.
Tepahues در سال 1620 با کورنیکاریس ترکیب شد. پدر میگل گودینز مأموریت های سان آندرس دو کورنیکاری و آسونسیون د تپاهویی را بنیان نهاد. . در همان سال بخش اعظم سان ایگناسیو تأسیس شد ، که علاوه بر پنج مأموریت ذکر شده در بالا ، مأموریت های باکام ، تورین و رهان ، واقع در دهانه Yaqui را شامل می شد.
در سال 1617 یاقوت ها توسط والدین پرز د ریواس و توماس باسیلیو تغییر مذهب دادند. علی رغم تحمل قیام ها ، شورش ها ، عذاب ها و قتل ها ، تغییر دین Sonora سریعتر و ایمن تر بود. در قرن هفدهم مسیحیان گسترش یافتند و مأموریت مایکوبا و یکورا را در قسمت جنوب غربی آنچه آنها را Chínipas می دانستند بنیان نهادند.
مأموریت ها از رودخانه یاکی به شمال به چهار کشور تقسیم شدند: سان بورخا گروه های مأموریت های: Cucumaripa و Tecoripa , در سال 1619 تاسیس شد موواس و اونواس ، در سال 1622 ؛ Sahuaripa در سال 1627 ؛ ماتاپه در سال 1629؛ Onapa در سال 1677 و Arivechi , در سال 1727. بخش اداری سه شهید مقدس ژاپن که شامل Batuco در 1627 ، Oposura در 1640 و Bacadeguachi , گوازاواس , سانتا ماریا باکراکا و سان میگوئل باویسپه , در سال 1645 تاسیس شد. و بخش مرکزی سن خاویر که مأموریتهای اورس را در سال 1636 ادغام کرد. Aconchi ، Opodepe و Banámichi در سال 1639 ؛ Cucurpe و Arizpe در سال 1648 و Cuaquiárachi در سال 1655.
در سال 1687 مبلغ Eusebio Francisco Kino وارد پیمریا آلتا شد و مأموریت های بخش ریاست Nuestra Señora de los Dolores را آغاز كرد و تأسیس كرد: كابوركا ، كه به وی فرانسیسكو خاویر Saeta منصوب شد كه با حمایت معنوی خود ، نامه نگاری ، نامه نگاری می كند. کینو آتیل ، توبوتاما ، بانوی غم و اندوه د ساریچ ، پیتیکیو ، آئیل ، اوکیتوآ ، مگدالنا ، سان ایگناسیو ، کوکوسپرا و ایموریس.
پس از اخراج یسوعیان ، این مأموریت ها به عهده فرانسیسی ها بود که دیگر هیچ گونه ساخت و سازی انجام ندادند و تنها به تلاش برای حفظ مأموریت های موجود محدود شدند. هنگامی که یسوعیان قبلاً شهرک هایی در سینالوآ و سونورا ایجاد کردند ، چشم خود را به قلمرو کالیفرنیا بستند.